Cardinalii l-au ales Papă în Conclavul din 16 octombrie 1978, luându-şi numele de Ioan Paul al II-lea. Pe 22 octombrie, şi-a inaugurat solemn pontificatul. Condus de preocuparea sa pastorală pentru toate bisericile şi de un simţ al deschiderii şi carităţii faţă de întreaga rasă umană, papa Ioan Paul al II-lea şi-a exercitat ministerul petrin cu un spirit misionar neobosit, dedicându-i toate energiile sale. A făcut 104 vizite pastorale în afara Italiei şi 146 în Italia. Ca episcop de Roma a vizitat 317 din cele 333 de parohii, face cunoscut revista Lumea Catolică, în 26 aprilie 2014, înaintea canonizării sale
La ora 18.20 a serii de 16 octombrie 1978, ”anul celor trei papi”, fumul alb de pe coșul Capelei Sixtine anunța alegerea unui nou pontif, care la 19.15 se prezenta la balconul bazilicii. Printr-un gest care a întrerupt o tradiție de secole, potrivit căreia noul ales rămânea în tăcere și binecuvânta mulțimea, Ioan Paul al II-lea a rostit un scurt discurs înainte de prima sa binecuvântare apostolică.
A avut mai multe întâlniri decât oricare dintre predecesorii săi cu oamenii şi cu liderii naţiunilor. Peste 17.600.000 de pelerini au participat la audienţele generale desfăşurate miercurea (peste 1.160), fără a calcula audienţele speciale şi ceremoniile religioase, precum şi milioanele de credincioşi întâlniţi în vizitele pastorale făcute în Italia şi în diverse părţi ale lumii. A făcut 38 de vizite oficiale şi a avut 738 de audienţe şi întâlniri cu şefi de state şi 246 de audienţe şi întâlniri cu prim-miniştri, arată revista Lumea Catolică.
Papa Ioan Paul al II-lea a fost primul papă care s-a deplasat într-o ţară majoritar ortodoxă, prin vizita în România din perioada 7-9 mai 1999.